MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 54735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015183	GC	3	6	109837	109842	0 %	0 %	50 %	50 %	325291550
2002	NC_015183	CCTC	2	8	109851	109858	0 %	25 %	0 %	75 %	325291550
2003	NC_015183	ACG	2	6	109860	109865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291550
2004	NC_015183	TCG	2	6	109929	109934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291550
2005	NC_015183	ACT	2	6	110356	110361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291551
2006	NC_015183	GAAT	2	8	110442	110449	50 %	25 %	25 %	0 %	325291551
2007	NC_015183	CGA	2	6	110473	110478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291551
2008	NC_015183	TCT	2	6	110500	110505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291551
2009	NC_015183	CGA	2	6	110515	110520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291551
2010	NC_015183	C	6	6	110532	110537	0 %	0 %	0 %	100 %	325291551
2011	NC_015183	ACG	2	6	110547	110552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291551
2012	NC_015183	CGA	2	6	110734	110739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291551
2013	NC_015183	GCG	2	6	110769	110774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291551
2014	NC_015183	GCC	2	6	110804	110809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291551
2015	NC_015183	GAT	2	6	110810	110815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291551
2016	NC_015183	CCG	2	6	110827	110832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291551
2017	NC_015183	CGG	2	6	110917	110922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291551
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2021	NC_015183	GCC	2	6	111102	111107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291551
2022	NC_015183	GTGATT	2	12	111108	111119	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325291551
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2024	NC_015183	GGCG	2	8	111155	111162	0 %	0 %	75 %	25 %	325291551
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2042	NC_015183	CAG	2	6	112069	112074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291552
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2045	NC_015183	TGGG	2	8	112168	112175	0 %	25 %	75 %	0 %	325291552
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2054	NC_015183	TCG	2	6	113047	113052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291553
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2057	NC_015183	CAT	2	6	113253	113258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291553
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2120	NC_015183	TGCC	2	8	116483	116490	0 %	25 %	25 %	50 %	325291554
2121	NC_015183	TGCG	2	8	116529	116536	0 %	25 %	50 %	25 %	325291554
2122	NC_015183	GC	4	8	116557	116564	0 %	0 %	50 %	50 %	325291554
2123	NC_015183	GTAT	2	8	116962	116969	25 %	50 %	25 %	0 %	325291555
2124	NC_015183	GTC	2	6	116974	116979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291555
2125	NC_015183	GCT	2	6	117197	117202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291556
2126	NC_015183	GCCTCG	2	12	117205	117216	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325291556
2127	NC_015183	CAT	2	6	117245	117250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
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2129	NC_015183	ACG	2	6	117370	117375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291556
2130	NC_015183	GAG	2	6	117381	117386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291556
2131	NC_015183	GC	3	6	117422	117427	0 %	0 %	50 %	50 %	325291556
2132	NC_015183	ATCT	2	8	117432	117439	25 %	50 %	0 %	25 %	325291556
2133	NC_015183	TCC	2	6	117465	117470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291556
2134	NC_015183	CAT	2	6	117479	117484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
2135	NC_015183	CGC	2	6	117506	117511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291556
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2141	NC_015183	GAG	2	6	117669	117674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291556
2142	NC_015183	CGT	2	6	117721	117726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291556
2143	NC_015183	CAT	2	6	117770	117775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291556
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2145	NC_015183	GC	3	6	117840	117845	0 %	0 %	50 %	50 %	325291556
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2149	NC_015183	CTCA	2	8	118025	118032	25 %	25 %	0 %	50 %	325291556
2150	NC_015183	GAT	2	6	118052	118057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291556
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2153	NC_015183	TGC	2	6	118105	118110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291556
2154	NC_015183	CGG	2	6	118116	118121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291556
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2162	NC_015183	CAG	2	6	118475	118480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291556
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2205	NC_015183	GC	4	8	120215	120222	0 %	0 %	50 %	50 %	325291557
2206	NC_015183	CGC	2	6	120226	120231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291557
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2229	NC_015183	CGG	2	6	121125	121130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291558
2230	NC_015183	ACC	2	6	121165	121170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291558
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2232	NC_015183	GGC	2	6	121383	121388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291558
2233	NC_015183	CAC	2	6	121407	121412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291558
2234	NC_015183	T	6	6	121687	121692	0 %	100 %	0 %	0 %	325291559
2235	NC_015183	ATTC	2	8	121798	121805	25 %	50 %	0 %	25 %	325291559
2236	NC_015183	T	7	7	121857	121863	0 %	100 %	0 %	0 %	325291559
2237	NC_015183	T	7	7	121926	121932	0 %	100 %	0 %	0 %	325291559
2238	NC_015183	ATT	2	6	121988	121993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291559
2239	NC_015183	CCG	2	6	121995	122000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291559
2240	NC_015183	TGC	2	6	122172	122177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2241	NC_015183	TGC	2	6	122196	122201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2242	NC_015183	GCAACC	2	12	122213	122224	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325291560
2243	NC_015183	TCA	2	6	122274	122279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2244	NC_015183	GC	3	6	122301	122306	0 %	0 %	50 %	50 %	325291560
2245	NC_015183	GGC	2	6	122312	122317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291560
2246	NC_015183	CCA	2	6	122319	122324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291560
2247	NC_015183	TCA	2	6	122334	122339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2248	NC_015183	CCG	2	6	122361	122366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291560
2249	NC_015183	GC	3	6	122393	122398	0 %	0 %	50 %	50 %	325291560
2250	NC_015183	GCC	2	6	122429	122434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291560
2251	NC_015183	CGGCG	2	10	122518	122527	0 %	0 %	60 %	40 %	325291560
2252	NC_015183	GTC	2	6	122546	122551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2253	NC_015183	CATC	2	8	122562	122569	25 %	25 %	0 %	50 %	325291560
2254	NC_015183	CTG	2	6	122621	122626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2255	NC_015183	GCG	2	6	122655	122660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291560
2256	NC_015183	CGC	2	6	122661	122666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291560
2257	NC_015183	GCGGTG	2	12	122714	122725	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	325291560
2258	NC_015183	CAG	2	6	122800	122805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2259	NC_015183	GAAG	2	8	122818	122825	50 %	0 %	50 %	0 %	325291560
2260	NC_015183	TGC	2	6	122850	122855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2261	NC_015183	CGG	3	9	122893	122901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291560
2262	NC_015183	GAG	2	6	122960	122965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291560
2263	NC_015183	AAT	2	6	123011	123016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291560
2264	NC_015183	TGA	2	6	123084	123089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291560
2265	NC_015183	GAT	2	6	123097	123102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291560
2266	NC_015183	AGC	2	6	123141	123146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2267	NC_015183	CAT	2	6	123163	123168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2268	NC_015183	GCT	2	6	123238	123243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2269	NC_015183	TTA	2	6	123253	123258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291560
2270	NC_015183	CAT	3	9	123271	123279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
2271	NC_015183	CTT	2	6	123343	123348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291560
2272	NC_015183	GCTGC	2	10	123376	123385	0 %	20 %	40 %	40 %	325291560
2273	NC_015183	GCT	3	9	123397	123405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2274	NC_015183	GCT	2	6	123424	123429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2275	NC_015183	GGA	2	6	123430	123435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291560
2276	NC_015183	CGA	2	6	123474	123479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2277	NC_015183	CCGA	2	8	123490	123497	25 %	0 %	25 %	50 %	325291560
2278	NC_015183	CTG	2	6	123509	123514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291560
2279	NC_015183	ATC	2	6	123536	123541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291560
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2281	NC_015183	AGA	3	9	123586	123594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291560
2282	NC_015183	GGT	2	6	123856	123861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291561
2283	NC_015183	GAG	2	6	123914	123919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291561
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2289	NC_015183	CGC	2	6	124061	124066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291562
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2292	NC_015183	AGC	2	6	124155	124160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291562
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2297	NC_015183	TGC	2	6	124468	124473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291562
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2312	NC_015183	CTTCGC	2	12	125010	125021	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	325291563
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2325	NC_015183	ACC	2	6	125482	125487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291563
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2328	NC_015183	GGC	2	6	125512	125517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291563
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2330	NC_015183	CAT	2	6	125610	125615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291563
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2332	NC_015183	GTC	2	6	125836	125841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291564
2333	NC_015183	CGA	2	6	125865	125870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291564
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2335	NC_015183	GCC	2	6	125881	125886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291564
2336	NC_015183	CTG	2	6	125911	125916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291564
2337	NC_015183	GGGTCT	2	12	125961	125972	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325291564
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2339	NC_015183	CGGT	2	8	126053	126060	0 %	25 %	50 %	25 %	325291564
2340	NC_015183	ACG	2	6	126148	126153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291564
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2343	NC_015183	ACC	2	6	126220	126225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291564
2344	NC_015183	CTG	2	6	126244	126249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291564
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2346	NC_015183	CGG	2	6	126346	126351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291564
2347	NC_015183	CGA	2	6	126357	126362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291564
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2350	NC_015183	CTT	2	6	126472	126477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291564
2351	NC_015183	TCG	2	6	126486	126491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291564
2352	NC_015183	CGAT	2	8	126497	126504	25 %	25 %	25 %	25 %	325291564
2353	NC_015183	GCG	2	6	126549	126554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291564
2354	NC_015183	GGC	2	6	126610	126615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291564
2355	NC_015183	TCA	2	6	126632	126637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291564
2356	NC_015183	GCT	2	6	126672	126677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291564
2357	NC_015183	GAC	2	6	126679	126684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291564
2358	NC_015183	CCA	2	6	126713	126718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291564
2359	NC_015183	TCG	2	6	126731	126736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291564
2360	NC_015183	CCA	2	6	126810	126815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291564
2361	NC_015183	TGA	2	6	126879	126884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291564
2362	NC_015183	CTG	2	6	126904	126909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291564
2363	NC_015183	TTC	2	6	126977	126982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291564
2364	NC_015183	CTT	2	6	127000	127005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291564
2365	NC_015183	CCG	2	6	127052	127057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291564
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2383	NC_015183	CTG	2	6	127841	127846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291565
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2460	NC_015183	CAT	2	6	131984	131989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291569
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2467	NC_015183	CCT	2	6	132213	132218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291570
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2471	NC_015183	AGGCC	2	10	132435	132444	20 %	0 %	40 %	40 %	325291570
2472	NC_015183	TGG	2	6	132450	132455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291570
2473	NC_015183	GCG	2	6	132463	132468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291570
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2478	NC_015183	GCG	2	6	132637	132642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291570
2479	NC_015183	CTG	2	6	132655	132660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291570
2480	NC_015183	TCA	2	6	132797	132802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291570
2481	NC_015183	GCC	2	6	132892	132897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291570
2482	NC_015183	GC	3	6	132919	132924	0 %	0 %	50 %	50 %	325291570
2483	NC_015183	TCA	2	6	132929	132934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291570
2484	NC_015183	CGG	2	6	132951	132956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291570
2485	NC_015183	ATG	2	6	132967	132972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291570
2486	NC_015183	CCGC	2	8	132998	133005	0 %	0 %	25 %	75 %	325291570
2487	NC_015183	CGG	2	6	133023	133028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291570
2488	NC_015183	TCG	2	6	133037	133042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291570
2489	NC_015183	GCT	2	6	133098	133103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291570
2490	NC_015183	GTG	2	6	133124	133129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291570
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2493	NC_015183	GC	3	6	133208	133213	0 %	0 %	50 %	50 %	325291570
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2497	NC_015183	CCGT	2	8	133319	133326	0 %	25 %	25 %	50 %	325291571
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